Название коллектива - Агентство по управлению реализацией проектов бассейна Аральского моря и Глобального экологического фонда не случайно. В настоящее время агентство реализует ряд проектов и программ, которые показали свою жизненность, некоторые из них - в развитие компонентов проекта GEF.
Агентство МФСА имеет статус международной организации и стало полноправным членом дипломатического корпуса Узбекистана.
С учетом результатов его деятельности, в целях концентрации возможностей и усилий национальных и международных организаций на смягчении последствий Аральского кризиса, Правительством Узбекистана на Агентство GEF возложены функции координатора проектов и программ в бассейне Аральского моря.